Jan 17, 2011 17:29
13 yrs ago
English term

genome read mapper

English to French Medical Genetics cartographie
"XXX is an advanced, open-source genome read mapper designed to maintain accuracy and high-performance as datasets scale to billions of reads with lengths beyond 100 nucleotides."

Une traduction littérale donnerait à peu près "Logiciel libre de cartographie de lectures du génome", mais je ne vois pas ce que pourrait être une "cartographie de lectures"...

Merci à tous.

Discussion

Germaine Jan 21, 2011:
mapper vs. read mapper Sur le Net, on semble faire une différence entre genome mapper et genome read mapper. Par exemple: http://genome.sph.umich.edu/wiki/Evaluating_a_Read_Mapper_on... ou http://www.nature.com/nbt/journal/v27/n5/full/nbt0509-455.ht...
Les "reads" semblent être des brins ou fragments. Je n'ai pas l'impression qu'on peut vraiment mettre de côté ces "lectures".

Proposed translations

+1
14 mins
Selected

outils de cartographie du génome , ou de cartographie génomique

J'aurais tendance à laisser tomber 'lecture' pour alléger


Accélérer l'identification des gènes responsables des maladies génétiques en mettant les outils de cartographie du génome à disposition de la communauté ...
www.afm-20ansdactions.com/.../guerir-cartographie-genome-hu...

La cartographie génétique est la construction d'une carte soit localisée autour d'un gène, soit à base large portant sur le génome entier. ...
fr.wikipedia.org/.../Cartographique_génétique - En
Peer comment(s):

agree Isabelle Bouchet : oui, mais au singulier
15 hrs
Something went wrong...
4 KudoZ points awarded for this answer. Comment: "Merci beaucoup Gilles, je pense en effet que le terme "lecture" n'est pas indispensable."
4 mins

cartographie établie par lecture du génome

Mais un ensemble de 4000 lectures couvrant parfaitement le génome sans aucun .... de réaliser une carte physique préalable, étape longue et fastidieuse, ...
www.snv.jussieu.fr/.../genomes/methodes_shotgun.htm
Something went wrong...
1 hr

logiciel de mappage génomique/du génome

(WO/2005/007814) MAPPAGE GENOMIQUE D'ELEMENTS D'ADN FONCTIONNELS ...
(FR) MAPPAGE GENOMIQUE D'ELEMENTS D'ADN FONCTIONNELS ET DE PROTEINES CELLULAIRES. (EN) GENOME MAPPING OF FUNCTIONAL DNA ELEMENTS AND CELLULAR PROTEINS ...
www.wipo.int/pctdb/fr/wo.jsp?WO=2005007814 - En cache
(WO/2005/007814) MAPPAGE GENOMIQUE D'ELEMENTS D'ADN FONCTIONNELS ... - [ Traduire cette page ]
(WO/2005/007814) MAPPAGE GENOMIQUE D'ELEMENTS D'ADN FONCTIONNELS ET DE ...
www.wipo.int/pctdb/fr/wo.jsp?WO=2005007814... - En cache
Plus de résultats de wipo.int
CNC/CODATA - activités relatives aux donnée
... et constitue le dépôt central officiel des données de mappage génomique qui ont été produites dans le cadre de l'Initiative du génome humain. ...
dac.cisti.nrc.ca/datact_f.cfm - En cache
CODATA - Rapport sur les activités relatives aux données au Canada ...
... et constitue le dépôt central officiel des données de mappage génomique qui ont été produites dans le cadre de l'Initiative du génome humain. ...
www.codata.org/canada/DAC/datact02_f.shtml - En cache
CODATA - Rapport sur les activités relatives aux données au Canada ...
... dans l'État de Maryland aux États-Unis en 1990, et constitue le dépôt ...
www.codata.org/canada/DAC/datact_f.shtml - En cache
Plus de résultats de codata.org
La langue Berbère - Page 2
25 messages - 8 auteurs - Dernier message : 13 sept. 2010
Voire ci dessous les resultats du mappage genomique de divers populations (Behar 2010) ...
www.algerie-dz.com › ... › Bouillon de Culture - En cache
La langue Berbère - Page 5 - Forum ALGERIE
10 messages - 3 auteurs - Dernier message : 12 sept. 2010
... qu'il a nomme macro-kushitique (de kush somalie) Voire ci dessous les resultats du mappage genomique de divers populations (Behar 2010) ...
ns365050.ovh.net/~algeried/forums/showthread.php?t... - En cache
CIPO - Patent - 2530810 - [ Traduire cette page ]
de XD FU - 2005 - Autres articles
... MAPPING OF FUNCTIONAL DNA ELEMENTS AND CELLULAR PROTEINS. (54) French Title: MAPPAGE GENOMIQUE D'ELEMENTS D'ADN FONCTIONNELS ET DE PROTEINES CELLULAIRES ...
patents.ic.gc.ca › Home › CPD - En cache
CIPO - Patent - 2530810 - Claims - [ Traduire cette page ]
... MAPPING OF FUNCTIONAL DNA ELEMENTS AND CELLULAR PROTEINS (54) French ...
brevets-patents.ic.gc.ca/opic-cipo/cpd/eng/.../claims.html?... - En cache
OPIC - Brevet - 2530810 - Revendications - [ Traduire cette page ]
... OF FUNCTIONAL DNA ELEMENTS AND CELLULAR PROTEINS (54) Titre français ...
patents.ic.gc.ca/opic-cipo/cpd/fra/.../revendications.html?... - En cache

pour le "genome read mapper", il s'agit d'un logiciel open-source:

genome read mapper download, free genome read mapper on software ... - [ Traduire cette page ]
genome read mapper Download, genome read mapper, genome read mapper free download, download genome read mapper for free software download in the downv.com.
www.downv.com/Mac-software.../genome-read-mapper - En cache


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Note added at 1 ora (2011-01-17 18:44:56 GMT)
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Comme il s'agit d'un nom de logiciel, je pense qu'il est inutile de le traduire. En fait je l'utiliserais entre guillements.
Something went wrong...

Reference comments

4 days
Reference:

genome read(s)

Read : This term designates a single sequencing operation as well as the information it delivers, i.e. a sequence which is 800-1000 bases long, generally from one of the extremities of a longer DNA fragment.
Lecture : Ce terme désigne une opération de séquençage unitaire ainsi que l’information qu’elle livre, c’est-à-dire une séquence de 800 à 1000 bases de long, généralement lue à une des extrémités d’un fragment d’ADN plus long.
http://www.cns.fr/spip/Glossaire.html

Fondamentalement, l’assemblage de lectures consiste à retrouver la séquence ayant été séquencée en choisissant une lecture initiale, en l’allongeant d’une seconde lecture chevauchante, puis en allongeant ces deux lectures d’une troisième, et ainsi de suite.
http://alcovna.genouest.org/le-projet-initial-janvier-2010/

"L’assemblage des lectures chevauchantes ne produit donc pas une séquence continue entière, mais des blocs de séquence, nommés contigs. Or les lectures sont obtenues à partir des
deux extrémités de fragments d’ADN de taille variable..."
http://www.cns.fr/spip/IMG/pdf/Strategies_sequencage.pdf
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