Glossary entry (derived from question below)
inglés term or phrase:
atop
español translation:
que la (lo) cubre
inglés term
Países Bajos
34 years' experience
Native in: español 
Works in: inglés al español, italiano al español, neerlandés al español
atop
no estoy segura del significado de atop en este caso
Mi intento:
Con respecto a la molécula inhibidora, se consideró como una subcapa de óxido o una película superpuesta de carbono (en ambos casos localizada en la interfase óxido/carbono) o distribuida homogéneamente por todo la profundidad de la película de óxido.
Dec 3, 2013 23:52: Flavio Granados F Created KOG entry
Proposed translations
Venezuela
In good terms, your deadline is mine
Native in: español (Variant: Latin American)
Works in: inglés al español
que la cubre
...o una película de carbono encima...
[del sustrato supongo, de carbono o la aleación que sea], como lo indica es una película intermedia definida, bien sea como capa de óxido o como película de carbono, entre la capa de óxido externa (¿pasivadora?) y el sustrato inferior.
Como en este caso:
"which is consistent with the formation of films, containing oxidised Fe, Cr, Mo species, atop the alloy substrates"
Ref: CORROSION RESISTANCE OF AUSTENITIC STAINLESS STEEL IN ACETIC ACID SOLUTION CONTAINING BROMIDE IONS
Estados Unidos
quality and accuracy
Native in: español (Variants: Honduran, Latin American, Peruvian, Venezuelan, Salvadoran, Argentine, Colombian, Dominican, Mexican, Puerto Rican, Guatemalan) 
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exterior
España
Technical/Medical/Marketing expert
Native in: español
Works in: inglés al español, inglés al portugués, portugués al español
una subcapa de óxido cubierta por una película de carbono
España
Carlos Blanco, B.Sc. in Chemistry
Accurate work on time, all the time.
Native in: español , inglés
Works in: inglés al español, español al inglés, portugués al inglés, and 1 more.
un sustrato de óxido *o* una película de carbono
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Note added at 3 hrs (2013-11-25 16:10:52 GMT)
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*The inhibitor* es considered to be either the oxide substrate or the, possibly adventitious, carbon film
Discussion
El término 'molecule' se ha usado en este caso como una metonimia, para referirse a la sustancia (pero tampoco diría "sustancia inhibidora", puesto basta con decir "inhibidor").
"The last mono-molecular layers are more complex to describe when cleaning or analyzing. Carbon/hydrocarbon based substances are known to rapidly (~1 hour) accumulate on most, if not all, freshly exposed surfaces. This “adventitious” carbon is well documented in clean rooms and vacuum systems and compositionally varies by environment. Adventitious carbon is a discontinuous layer of approximately ~0.2-1 nanometers thick or ~0.02 to 0.1 μg/cm² (for ρ = 1). The last mono-layer fractions may in some cases be strongly adsorbed to the surface as a “corrosion” layer."
(En http://www.ligo.caltech.edu/~rtaylor/your folder/FTIR-LHO-12...
En cuanto a la interpretación de 'atop', como comenté en mi mensaje anterior, hay que pensar en la película del inhibidor vista desde cada uno de los lados (desde la capa de óxido o desde la capa de la impureza orgánica).
For this work, expressions for core level intensities were formulated, assuming that the surface region consists of three distinct layers, namely a topmost layer of adventitious carbon, followed by the cationic (oxide) film, and finally the X52 steel substrate (Fe0) [7].
Por otro lado, creo entender que describen la película de inhibidor (en la hipótesis de que se forme una película entre las dos fases) "mirándola" desde los dos lados: como una subcapa de la capa de óxido o como una película sobre la superficie del acero (si se trata vde acero al carbono).
Ya me dirás si mo interpretación es correcta.